ईडीआई मॉड्यूल में कटियन एक्सचेंज झिल्ली, आयन एक्सचेंज झिल्ली और आयन एक्सचेंज रेजिन की वैकल्पिक परतें होती हैं, जो वैकल्पिक विलवणीकरण और ध्यान केंद्रित कक्षों के साथ एक झिल्ली स्टैक संरचना बनाती हैं। डीसी वोल्टेज के तहत, पानी में धनायन और आयन अपने संबंधित इलेक्ट्रोड में चले जाते हैं: धनायन, धनायन विनिमय झिल्ली से होकर सांद्र कक्ष में गुजरते हैं लेकिन आयन विनिमय झिल्ली द्वारा अवरुद्ध हो जाते हैं, जबकि आयन आयन विनिमय झिल्ली से गुजरते हैं लेकिन धनायन विनिमय झिल्ली द्वारा अवरुद्ध हो जाते हैं, इस प्रकार चयनात्मक आयन प्रतिधारण प्राप्त होता है।
अलवणीकरण कक्ष में मिश्रित राल बिस्तर तीन सहक्रियात्मक प्रभावों के माध्यम से गतिशील शुद्धि प्राप्त करता है: पहला, यह आयन विनिमय के माध्यम से पानी से अशुद्धता आयनों को सोख लेता है; फिर, एक विद्युत क्षेत्र द्वारा संचालित, अधिशोषित आयन सांद्रण कक्ष में चले जाते हैं; एक साथ, पानी के अणु इलेक्ट्रोलिसिस से उत्पन्न H⁺ और OH⁻ लगातार राल को पुनर्जीवित करते हैं, जिससे इसकी विनिमय क्षमता बनी रहती है। यह स्व-पुनर्जनन तंत्र रासायनिक पुनर्जनन के लिए सिस्टम शटडाउन की आवश्यकता को समाप्त कर देता है।